1998.04.01~1998.01.27

Destron機甲軍團突然出現於和平的惑星Gaia，他們的目的是為了惑星的神秘能量-安哥拉摩亞能量。Cybertron軍為了阻止Destron而到達惑星Gaia，Cybertron軍複製惑星上動物的形態作Beast Mode，Destron就從惑星上的電腦套取資料作為Machine Mode，新的Beast War就此爆發！
不久，惑星上的Insectron及突如其來的宇宙海賊Seacon等第三勢力使戰爭複雜化，從司令官Loiconvoy的Matrix孕育出來的年輕戰士Liojunior成為Cybertron重要的戰士。Destron的主要成員得到安哥拉摩亞能量而進化，成為Cyborg Beast。最後，Galvatron的人工惑星Nemesis接近Gaia並吸取安哥拉摩亞能量，為阻止Nemesis，Cybertron飛出Gaia前往Nemesis！
Nemesis成了最終戰的序幕，Cybertron能否阻止Galvatron的計劃？Lioconvoy與Liojunior這對組合將擦出新的火花！

全43話